​La línea de actuación Fortalecimiento integral de sistemas de calidad y equitativos tiene como principal objetivo favorecer el acceso universal a los servicios integrales de salud, manteniendo la equidad y la reducción de las desigualdades como uno de los retos principales a abordar. Para ello, INTERCOONECTA, en alineamiento con el IV Plan Director de la Cooperación Española, y desde un enfoque de gestión por resultados, contribuirá, a través de la planificación de acciones de capacitación precisas y adecuadas, a las necesidades y a las prioridades de América Latina y el Caribe para fortalecer la cobertura universal de los sistemas públicos de salud de los países de Iberoamérica y a fomentar la investigación y el desarrollo en salud. ​

Asimismo, para la consecución de estos dos resultados de desarrollo es necesario el cumplimiento de ciertos objetivos que deben promoverse desde el ámbito institucional público. No obstante, la cobertura universal quedará fortalecida a través de la formulación de políticas públicas destinadas al fortalecimiento de los sistemas de salud; del desarrollo de instituciones equitativas, eficientes y sostenibles; y del incremento y la mejora en eficiencia y calidad de la cantera de profesionales. A su vez, la investigación en salud se verá notablemente reforzada mediante el aumento de la financiación I+D y la extensión de la misma a todos los procesos de salud. ​